الفرق الرئيسي هو أن الخلية النباتية تمتلك جداراً خلوياً وبلاستيدات خضراء وفجوة عصارية كبيرة، بينما الخلية الحيوانية لا تمتلك هذه الأجزاء وتتميز بوجود أجسام مركزية.
تعد الخلية وحدة البناء والوظيفة في جميع الكائنات الحية، وعلى الرغم من التشابه الكبير بين الخلية النباتية والخلية الحيوانية في وجود مكونات أساسية مثل النواة، السيتوبلازم، والغشاء البلازمي، إلا أن هناك فروقاً جوهرية تكيفت مع طبيعة حياة كل منهما.
تتميز الخلية النباتية بوجود جدار خلوي صلب يحيط بالغشاء البلازمي، وهو مكون من مادة السليلوز التي تمنح النبات شكلاً ثابتاً وتدعم هيكله. كما تحتوي الخلية النباتية على بلاستيدات خضراء، وهي عضيات متخصصة تحتوي على صبغة الكلوروفيل التي تمكن النبات من القيام بعملية البناء الضوئي لصنع غذائه بنفسه. بالإضافة إلى ذلك، تحتوي الخلية النباتية على فجوة عصارية مركزية كبيرة الحجم تعمل على تخزين الماء والمواد الغذائية والفضلات، مما يساعد في الحفاظ على ضغط الخلية.
في المقابل، تفتقر الخلية الحيوانية إلى الجدار الخلوي، مما يجعل شكلها غير ثابت أو مرناً، وتكتفي بالغشاء البلازمي الذي يحيط بها. ولا تحتوي الخلايا الحيوانية على بلاستيدات خضراء لأن الحيوانات كائنات غير ذاتية التغذية تحصل على غذائها من مصادر خارجية. أما الفجوات في الخلية الحيوانية، فتكون صغيرة جداً ومؤقتة، وتوجد في الخلايا الحيوانية أجسام مركزية تلعب دوراً مهماً في عملية انقسام الخلية، وهي تراكيب لا توجد عادة في معظم الخلايا النباتية الراقية.