الجهاز التنفسي في الثدييات يختلف عن باقي المخلوقات في عدة نقاط أساسية:
وجود رئتين مع حويصلات هوائية لزيادة كفاءة تبادل الغازات.
استخدام الحجاب الحاجز للتنفس.
تحكم عصبي دقيق في عملية التنفس.
تكيفات خاصة للثدييات البحرية للغوص.
بينما تمتلك المخلوقات الأخرى أنظمة تنفسية متنوعة مثل الخياشيم في الأسماك، والأكياس الهوائية في الطيور، والتنفس الجلدي في بعض البرمائيات.